首先我們都知道，飲用水在線監測主要是用來保護水源，讓人們有個健康的水源。多年以來，環保部門對飲用水實施在線監測，對水源保護起到了支撐作用。但是實踐中，飲用水在線監測面臨一些挑戰問題。分析如下：
適當增加指標和頻次
結合地域情況，參照生活飲用水標準適度增減控制項目，比如增加農藥、有機物和地域特征等指標。要根據水源規模大小、水文水情、監測條件等實際情況，盡量多布設斷面和點位。要根據飲用水源匯水條件、賦存條件、保護程度等具體情形，遴選監測項目和監測方法，適度增加監測頻次，進行采樣監測和評價水質。
全面實施在線監測
縣城和重點鄉鎮以上地區集中式飲用水水源應建設水質在線監控系統，對飲用水水源水質全面實施在線監測。適時掌握飲用水源水量、水質、水文情況及其變化趨勢，提升飲用水源預警監測和應急監測能力。飲用水在線監測取水點水質要有代表性，監測項目和監測時次要能夠適時反映水質狀況，配套機房、傳輸設施、監控平臺建設要合理實用，保證飲用水源水質在線監測系統正常運轉，充分發揮保護水源的作用。
完善監測報告工作
飲用水環境監測報告不同于一般的化驗單，是以報告的形式完成對環境管理和經濟建設的技術支持和服務功能。因此，應不斷完善監測報告工作。要對水源地環境監測數據進行深度分析和綜合評價，獲取詳實、科學、可信的評價結論，提出可行的保護水源水質建議，供有關部門及時有效運用。
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