醫院廢水是一種低濃度廢水，除了有有機的和無機的污染物，如各種藥物、消毒劑、解剖遺棄物等污染物，還含存在著大量病菌、病毒和寄生蟲，成份較為復雜。這些廢水如果沒有經過處理就直接排出水體，會對周圍水域或土壤造成嚴重污染。那么安全處理醫院廢水，將其水進行在線監測是必須的。醫院廢水水質監測中常見的問題如下：
1.因病員人數有波動性，廢水的排放量也有波動，而定時定量的給藥機不能及時根據廢水的排放量增減而調整給藥量，專職人員操作的滯后性等等諸多方面導致醫院廢水排放的時候余氯不達標、大腸菌群數超標等問題；
2.使用的化學物品具有強烈的腐蝕性，長期使用很容易導致管路的破損而導致給藥機組的停用，就算專職人員按時用清水沖洗管路，那也只是延長了管路的耐腐蝕時間，不能從根本上解決問題。如果后勤部門不能及時修補，導致廢水未經消毒直接排放，盡管發生的次數很少，但是還是有發生。
3.因為廢水處理中心的事情繁多，每日和每月需要檢測的數據也多，每月環境衛生學采樣一天要采樣三份，而廢水專職人員間的相互配合顯得尤其重要，專職人員每日的工作思路要清晰，否則工作很容易遺漏。
 
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