其中地表水水質監測站中配水單元的功能是將采水單元所采集到的樣品根據所有水在線分析儀和設備的用水水量、水質和水壓的要求分配到各個分析單元和相應設備。
系統將采水系統采集的源水分為兩路，原水第一路直接進入多參數（溫度、pH、溶解氧、電導率、濁度）流通槽；第二路經沉淀過濾后直接供給氨氮分析儀、總磷在線分析儀等儀器進行分析。兩路原水的不同預處理方式能保證各分析儀表對測量水質的要求，既不失水樣的代表性，又能對各類分析儀表起到保護作用。
配水單元包括流量和壓力調節及系統清洗兩個部分。其中流量和壓力調節部分保證各分析儀表進水壓力和流量滿足其分析要求；預處理單元可以保證各水質分析儀表對進水水質的要求；系統清洗單元用于保證系統長周期穩定可靠運行。